Wewnętrzna walidacja RapidHIT^TM 200 – systemu zautomatyzowanej identyfikacji człowieka na podstawie analizy DNA

• Authors: Anna Brągoszewska , Ewa Kartasińska , Paweł Wierzchowski , Jakub Mondzelewski

Title variants

EN

Internal validation of RapidHIT^TM 200 – a system for automated human identification using DNA analysis

Abstracts

EN

RapidHITTM 200 by IntegenX® (Thermo Fisher Scientific) is an integrated system for fast human identification based on STR analysis, providing a number of advantages over traditional DNA profiling methods in terms of automation, speed of analysis and mobility. However, before rapid DNA technology could be implemented into routine forensic applications, both workflow and its results would have to be rigorously validated for reliability, performance and compatibility with data obtained from capillary electrophoresis, through an internal validation. As we were primarily interested in the RapidHITTM 200’s ability to efficiently generate DNA profiles from samples collected at crime scenes and to upload this data to the CODIS database (Combined DNA Index System), the evaluation study focused mainly on such samples. The results show that RapidHITTM 200 can be a useful tool to complement conventional identification methods used in forensic genetics.

PL

RapidHITTM 200 firmy IntegenX® (Thermo Fisher Scientific) to zintegrowany system służący do szybkiej identyfikacji osobniczej na podstawie analizy STR, zapewniający szereg korzyści w porównaniu z klasycznymi metodami profilowania DNA pod względem automatyzacji, szybkości analizy i mobilności. Niemniej przed wdrożeniem technologii rapid DNA do rutynowych aplikacji kryminalistycznych, zarówno proces badawczy, jak i wyniki muszą zostać rygorystycznie sprawdzone pod względem niezawodności, wydajności i kompatybilności z danymi uzyskanymi w oparciu o analizy wykonywane z wykorzystaniem technologii elektroforezy kapilarnej, poprzez przeprowadzenie wewnętrznego procesu walidacji. Ponieważ w obrębie naszych zainteresowań była przede wszystkim zdolność urządzenia RapidHITTM 200 do efektywnego oznaczania profili DNA z próbek zabezpieczanych na miejscach zdarzeń kryminalnych i pozyskiwanie tych danych do bazy CODIS (ang. Combined DNA Index System), przeprowadzone badania ewaluacyjne skupiły sią głównie na tego typu próbkach. Wyniki przeprowdzonych badań pokazują, iż RapidHITTM 200 może być użytecznym narzędziem uzupełniającym konwecjonalne metody identyfikacyjne stosowane w genetyce sądowej.

Keywords

PL

rapid DNA; genetyka sądowa; RapidHITTM 200; analiza ST

EN

rapid DNA; forensic genetics; RapidHITTM 200; STR analysis

• Publisher: Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji
• Journal: Problemy Kryminalistyki
• Year: 2021
• Issue: 314

Dates

published

2021

Contributors

author

Anna Brągoszewska

• Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji

author

Ewa Kartasińska

• Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji

author

Paweł Wierzchowski

• Laboratorium Kryminalistyczne Komendy Głównej Policji w Katowicach

author

Jakub Mondzelewski

• Centralne Laboratorium Kryminalistyczne Policji

References

• Alshehhi, A., Roy, R. (2015). Generating rapid DNA profiles from crime scene samples commonly encountered in the United Arab Emirates. Journal of Forensic Research, 6. https://doi. org/10.4172/2157-7145.1000296.
• Butler, J.M., Buel, E., Crivellente, F., McCor, B.R. (2004). Forensic DNA typing by capillary electrophoresis using the ABI Prism 310 and 3100 genetic analyzers for STR analysis. Electrophoresis, 25.
• ENFSI, (2010). Recommended Minimum Criteria for Validation of Various Aspects of the DNA Profiling Process.
• Gangano, S., Elliott, K., Anoruo, K., Gass, J., Buscaino, J., Jovanovich, S., Harris, D. (2013). DNA investigative lead development from blood and saliva samples in less than two hours using the RapidHITTM Human DNA Identification System. Forensic Science International: GeneticsSupplement Series, 4. https://doi.org/10.1016/j. fsigss.2013.10.022.
• Gill, P., Gusmão, L., Haned, H., Mayr, W.R., Morling, N., Parson, W., Prieto, L., Prinz, M., Schneider, H., Schnider, P.M., Weir, B.S. (2012). DNA Commission of the International Society of Forensic Genetics: Recommendations on the evaluation of STR typing results that may include drop-out and/or drop-in using probabilistic methods. Forensic Science International: Genetics, 6(6). https:// doi. org/10.1016/j.fsigen.2012.06.002.
• Gilder, J.R., Doom, T.E., Inman, K., Krane, D.E. (2007). Run-specific limits of detection and quantitation for STR-based DNA testing. Journal of Forensic Sciences, 52(1).
• Hansson, O., Gill, P., Egeland, T. (2014). STR-validator: An open source platform for validation and process control. Forensic Science International: Genetics, 13.
• Hennessy, L.K., Franklin, H., Li, Y., Buscaino, J., Chear, K., Gass, J., Mehendale, N., Williams, S., Jovanovich, S., Harris, D., Elliott, K., Nielsen, W. (2013). Developmental validation studies on the RapidHITTM Human DNA Identication System. Forensic Science International: Genetics Supplement Series, 4. https://doi.org/10.1016/j. fsigss.2013.10.003.
• Holland, M., Wendt, F. (2015). Evaluation of the RapidHITTM 200, an automated human identication system for STR analysis of single source samples. Forensic Science International: Genetics, 14. https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2014.08.010.
• Jovanovich, S., Bogdan, G., Belcinski, R., Buscaino, J., Burgi, D., Butts, E.L.R., Chear, K., Ciopyk, B., Eberhart, D., El-Sissi, O., Franklin, H., Gangano, S., Gass, J., Harris, D., Hennessy, L., Kindwall, A., King, D., Klevenberg, J., Li, Y., Mehendale, N., McIntosh, R., Nielsen, B., Park, C., Pearson, F., Schueren, R., Stainton, N., Troup, C., Vallone, P.M., Vangbo, M., Woudenberg, T., Wyrick, D., Williams, S. (2015). Developmental validation of a fully integrated sample-to-profile rapid human identication system for processing single-source reference buccal samples. Forensic Science International: Genetics, 16. https://doi. org/10.1016/j.fsigen.2014.12.004.
• Kartasińska, E., Jurga, A. (2020). Rapid DNA – technologia umożliwiająca zautomatyzowaną, szybką analizę profili DNA wykorzystującą polimorfizm loci STR. Problemy Kryminalistyki, 309.
• Morgan, R., Illidge, S., Wilson-Wilde, L. (2019). Assessment of the potential investigative value of a decentralised rapid DNA workflow for reference DNA samples. Forensic Science International, 294.
• SWGDAM, (2016). Validation guidelines for DNA analysis methods.
• Tan, E., Turingan, R.S., Hogan, C., Vasantgadkar, S., Palombo, L., Schumm, J.W., Selden, R.F. (2013). Fully integrated, fully automated generation of short tandem repeat profiles. Investigative Genetis, 4(1).
• Thong, Z., Phua, Y.H., Loo, E.S., Goh, S.K., Ang, J., Looi, W.F., Syn, C.K.C. (2015). Evaluation of the RapidHITTM 200 system: a comparative study of its performance with Maxwell® DNA IQTM/ Identi ler® plus/ABI 3500xL workow. Forensic Science International: Genetics, 19. https://doi. org/10.1016/j.fsigen.2015.05.006.
• Verheij, S., Clarisse, L., van den Berge, M., Sijen, T. (2013). RapidHITTM 200, a promising system for rapid DNA analysis. Forensic Science International: Genetics Supplement Series, 4. https://doi. org/10.1016/j.fsigss.2013.10.130.

Identifiers

DOI

10.34836/pk.2021.314.1

Biblioteka Nauki

23050935